Für Agroforst eignen sich die klassichen Hochstamm-Obstbaumarten, sowie Nussbäume und Edelkastanien. Bei der Kombination mit Ackerkulturen, sollten Baumarten gewählt werden, deren Früchte später geerntet werden als die Ackerkultur.
Auch Wildobstarten, wie Speierling, Elsbeere, Vogelkirsche, Wildapfel, Wildbirne und Maulbeerbaum sind in Agroforst-Systemen interessant. Sie liefern gesuchtes Wertholz. Die Früchte lassen sich zu Spezialitäten verarbeiten. Wildobstbäume gelten nach der Direktzahlungsverordnung ebenfalls als Hochstamm-Obstbäume (sofern sie entsprechend ergzogen sind) und sind somit beitragsberechtigt. Eiche, Ahorn oder Linden eignen sich ebenso für die Wertholzgewinnung, sie sind jedoch nicht beitragsberechtigt.
Für die Pflanzung in Rebflächen sind konkurrenzschwache, licht belaubte Bäume und Sträucher geeignet. Typische Baumarten im Vitiforst sind Kopfweiden, Pflaume und Mirabelle, Weinbergpfirsich, Aprikose, Granatapfel, Maulbeer- und Mandelbäume.